Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FxnO35943 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FxnO35943 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FxnO35943 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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FxnO35943 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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FxnO35943 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FxnO35943 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FxnO35943 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FxnO35943 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FxnO35943 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FxnO35943 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FxnO35943 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FxnO35943 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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FxnO35943 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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FxnO35943 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FxnO35943 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FxnO35943 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FxnO35943 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FxnO35943 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms