Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CaluO35887 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CaluO35887 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaluO35887 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaluO35887 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaluO35887 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaluO35887 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaluO35887 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaluO35887 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaluO35887 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaluO35887 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaluO35887 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaluO35887 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaluO35887 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaluO35887 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaluO35887 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaluO35887 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaluO35887 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CaluO35887 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CaluO35887 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CaluO35887 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CaluO35887 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CaluO35887 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CaluO35887 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaluO35887 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaluO35887 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CaluO35887 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CaluO35887 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CaluO35887 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CaluO35887 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CaluO35887 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CaluO35887 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CaluO35887 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CaluO35887 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CaluO35887 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CaluO35887 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CaluO35887 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CaluO35887 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaluO35887 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CaluO35887 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CaluO35887 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CaluO35887 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CaluO35887 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CaluO35887 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CaluO35887 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaluO35887 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CaluO35887 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CaluO35887 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CaluO35887 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CaluO35887 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CaluO35887 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CaluO35887 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CaluO35887 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CaluO35887 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CaluO35887 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CaluO35887 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CaluO35887 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CaluO35887 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CaluO35887 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.2 ms