Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn6O35646 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn6O35646 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn6O35646 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn6O35646 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn6O35646 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn6O35646 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms