Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn1mwO35599 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn1mwO35599 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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