Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk2O35491 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk2O35491 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk2O35491 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk2O35491 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clk2O35491 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk2O35491 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk2O35491 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk2O35491 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clk2O35491 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clk2O35491 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms