Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6aO35464 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6aO35464 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms