Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf11aO35305 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf11aO35305 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms