Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Pkd2O35245 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Pkd2O35245 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Pkd2O35245 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30,88■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Pkd2O35245 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,4 ms