Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx3O35160 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx3O35160 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx3O35160 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms