Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4dO09126 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sema4dO09126 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema4dO09126 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4dO09126 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4dO09126 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4dO09126 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4dO09126 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4dO09126 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms