Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NumblO08919 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NumblO08919 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NumblO08919 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NumblO08919 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NumblO08919 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NumblO08919 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NumblO08919 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NumblO08919 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NumblO08919 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NumblO08919 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NumblO08919 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NumblO08919 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NumblO08919 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NumblO08919 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NumblO08919 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NumblO08919 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NumblO08919 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NumblO08919 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NumblO08919 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NumblO08919 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NumblO08919 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NumblO08919 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NumblO08919 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NumblO08919 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NumblO08919 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NumblO08919 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NumblO08919 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NumblO08919 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NumblO08919 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NumblO08919 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NumblO08919 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NumblO08919 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NumblO08919 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NumblO08919 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NumblO08919 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NumblO08919 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NumblO08919 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NumblO08919 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NumblO08919 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NumblO08919 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NumblO08919 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NumblO08919 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NumblO08919 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NumblO08919 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NumblO08919 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NumblO08919 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NumblO08919 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NumblO08919 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NumblO08919 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NumblO08919 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NumblO08919 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NumblO08919 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NumblO08919 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NumblO08919 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NumblO08919 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NumblO08919 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NumblO08919 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NumblO08919 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NumblO08919 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NumblO08919 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NumblO08919 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NumblO08919 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NumblO08919 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NumblO08919 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NumblO08919 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NumblO08919 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NumblO08919 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NumblO08919 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NumblO08919 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NumblO08919 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NumblO08919 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NumblO08919 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NumblO08919 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NumblO08919 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NumblO08919 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NumblO08919 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NumblO08919 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NumblO08919 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NumblO08919 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms