Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eftud2O08810 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eftud2O08810 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms