Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcof1O08784 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcof1O08784 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcof1O08784 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms