Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MttpO08601 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MttpO08601 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MttpO08601 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MttpO08601 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MttpO08601 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MttpO08601 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MttpO08601 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MttpO08601 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MttpO08601 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MttpO08601 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MttpO08601 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MttpO08601 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MttpO08601 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MttpO08601 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MttpO08601 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MttpO08601 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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MttpO08601 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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MttpO08601 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MttpO08601 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MttpO08601 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MttpO08601 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MttpO08601 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MttpO08601 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MttpO08601 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MttpO08601 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MttpO08601 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MttpO08601 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MttpO08601 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MttpO08601 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MttpO08601 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MttpO08601 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MttpO08601 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MttpO08601 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MttpO08601 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MttpO08601 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MttpO08601 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MttpO08601 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MttpO08601 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MttpO08601 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MttpO08601 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MttpO08601 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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MttpO08601 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MttpO08601 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MttpO08601 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MttpO08601 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MttpO08601 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MttpO08601 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MttpO08601 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MttpO08601 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MttpO08601 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MttpO08601 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MttpO08601 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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MttpO08601 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MttpO08601 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MttpO08601 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MttpO08601 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MttpO08601 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MttpO08601 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MttpO08601 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MttpO08601 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MttpO08601 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MttpO08601 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MttpO08601 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MttpO08601 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MttpO08601 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MttpO08601 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MttpO08601 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MttpO08601 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MttpO08601 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MttpO08601 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms