Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp35M0QWN7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp35M0QWN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms