Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5730507C01RikJ3QPX0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5730507C01RikJ3QPX0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms