Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm16427J3QN52 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm16427J3QN52 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm16427J3QN52 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms