Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20918J3QN17 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms