Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp616J3QN14 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp616J3QN14 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp616J3QN14 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms