Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AK157302I3ITR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AK157302I3ITR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AK157302I3ITR1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms