Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sclt1G5E861 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sclt1G5E861 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sclt1G5E861 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms