Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rnf148G3X9R7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms