Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2610008E11RikG3X964 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2610008E11RikG3X964 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2610008E11RikG3X964 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
2610008E11RikG3X964 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms