Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17455G3UW87 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17455G3UW87 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17455G3UW87 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17455G3UW87 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17455G3UW87 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Gm17455G3UW87 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17455G3UW87 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17455G3UW87 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17455G3UW87 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17455G3UW87 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17455G3UW87 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17455G3UW87 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17455G3UW87 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Gm17455G3UW87 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Gm17455G3UW87 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Gm17455G3UW87 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gm17455G3UW87 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17455G3UW87 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms