Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp32F8VPZ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp32F8VPZ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp32F8VPZ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp32F8VPZ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp32F8VPZ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp32F8VPZ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Usp32F8VPZ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp32F8VPZ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms