Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5160F8VPN3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5160F8VPN3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5160F8VPN3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5160F8VPN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms