Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3371F7CQW8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3371F7CQW8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3371F7CQW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3371F7CQW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms