Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
D430041D05RikF6ZGR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
D430041D05RikF6ZGR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
D430041D05RikF6ZGR6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms