Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20538F6Z9R1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20538F6Z9R1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms