Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1bF6V0H0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1bF6V0H0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1bF6V0H0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1bF6V0H0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1bF6V0H0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1bF6V0H0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1bF6V0H0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1bF6V0H0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms