Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28305F6U473 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28305F6U473 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms