Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngap1F6SEU4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngap1F6SEU4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngap1F6SEU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms