Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm340F6RGI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm340F6RGI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm340F6RGI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms