Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm29094F6Q785 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm29094F6Q785 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm29094F6Q785 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms