Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc7bE9Q9Y3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc7bE9Q9Y3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms