Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc74aE9Q9U8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc74aE9Q9U8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc74aE9Q9U8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms