Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp31E9Q6Y8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp31E9Q6Y8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms