Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC051665E9Q623 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BC051665E9Q623 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC051665E9Q623 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms