Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms