Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdr1E9Q0B4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdr1E9Q0B4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cdr1E9Q0B4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdr1E9Q0B4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms