Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ErmardE9Q048 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ErmardE9Q048 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ErmardE9Q048 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms