Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rsf1E9PWW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rsf1E9PWW9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rsf1E9PWW9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rsf1E9PWW9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rsf1E9PWW9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rsf1E9PWW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms