Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim5E9PV98 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim5E9PV98 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim5E9PV98 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms