Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zfp839E9PUU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp839E9PUU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp839E9PUU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms