Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Soga1E1U8D0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Soga1E1U8D0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Soga1E1U8D0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Soga1E1U8D0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms