Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1330D3Z460 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm1330D3Z460 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm1330D3Z460 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms