Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930467E23RikD3Z1P8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930467E23RikD3Z1P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms