Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc11B2RXC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc11B2RXC1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc11B2RXC1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc11B2RXC1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.3 ms