Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rd3lB2RV38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rd3lB2RV38 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms