Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc8B2RUS7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc8B2RUS7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Abcc8B2RUS7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Abcc8B2RUS7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Abcc8B2RUS7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
Abcc8B2RUS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Abcc8B2RUS7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms